La Federació Andorrana de Natació es va fundar el 23 d’octubre de l’any 1985, amb una única disciplina, la natació.
Els primers clubs afiliats van ser les escoles Sant Ermengol (que l’any 1987 es va convertir en club), Janer i Lycée.
El primer president va ser Joan Borra i Navarro, a qui van seguir Albert Gelabert Grau, Francesc Gran Fornell, Jordi Cerqueda Sierra, Aitor Osorio Martí i Younes Raguig.
En l’actualitat hi ha 9 clubs afiliats que detallem en la següent llista:
– CLESER
– C.N. SERRADELLS
– C.N. ESCALDES
– C.N. ENCAMP
– C.E. LAUESPORT
– SAECE (PAS DE LA CASA)
– C.N. SINCRONITZADA SERRADELLS
– C.W. TAURONS
– C.N. TRISTAINA AIGÜES OBERTES SAECO (ORDINO).

Disciplines:
Com ja hem comentat la primera disciplina va ser la natació que va néixer amb la FAN l’any 1985. La temporada 1986/87 va començar la natació sincronitzada que va estar activa només dues temporades. Es va reactivar la temporada 2000/01 però la seva consolidació es va produir l’any 2003 amb la celebració a Andorra de l’Europeu de sincronitzada.
La pràctica del Waterpolo en l’àmbit dels clubs va començar l’any 2004.